Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Acta1P68134 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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