Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgb1P63158 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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