Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl23P62830 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms