Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2fP61219 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms