Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf13P61216 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf13P61216 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms