Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d1P61080 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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