Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms