Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms