Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms