Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox5P52651 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox5P52651 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox5P52651 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox5P52651 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox5P52651 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox5P52651 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox5P52651 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox5P52651 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms