Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc1a1P51906 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc1a1P51906 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms