Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HpdP49429 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HpdP49429 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HpdP49429 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HpdP49429 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HpdP49429 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HpdP49429 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HpdP49429 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HpdP49429 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HpdP49429 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HpdP49429 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HpdP49429 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HpdP49429 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HpdP49429 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HpdP49429 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms