Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms