Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms