Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms