Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atxn10P28658 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atxn10P28658 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atxn10P28658 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atxn10P28658 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atxn10P28658 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atxn10P28658 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atxn10P28658 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atxn10P28658 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atxn10P28658 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Atxn10P28658 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Atxn10P28658 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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