Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms