Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl3P27659 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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