Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NdnP25233 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms