Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf8P23611 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf8P23611 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf8P23611 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf8P23611 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.6 ms