Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ggta1P23336 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ggta1P23336 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ggta1P23336 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ggta1P23336 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ggta1P23336 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ggta1P23336 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms