Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms