Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms