Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ntf3P20181 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms