Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P20040 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P20040 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P20040 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms