Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P18529 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P18529 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18529 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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