Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtcP11725 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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OtcP11725 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtcP11725 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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