Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PolP11369 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PolP11369 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PolP11369 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PolP11369 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PolP11369 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PolP11369 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PolP11369 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PolP11369 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PolP11369 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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