Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CatspereP0DP43 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms