Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb1P09055 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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