Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04214 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04214 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04214 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P04214 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04214 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.05■□□□□ 0
P04214 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04214 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04214 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P04214 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04214 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms