Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P04213 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P04213 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P04213 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
P04213 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P04213 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P04213 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P04213 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
P04213 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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