Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms