Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sp1O89090 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sp1O89090 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sp1O89090 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sp1O89090 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sp1O89090 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sp1O89090 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sp1O89090 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sp1O89090 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp1O89090 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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