Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MscO88940 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MscO88940 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MscO88940 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MscO88940 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MscO88940 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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MscO88940 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MscO88940 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MscO88940 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MscO88940 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MscO88940 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MscO88940 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MscO88940 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MscO88940 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MscO88940 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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