Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms