Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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