Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xbp1O35426 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms