Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms