Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms