Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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