Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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