Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm20834J3QM72 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20834J3QM72 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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