Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gm21818J3KMS6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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