Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn20G5E8X0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn20G5E8X0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms