Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms