Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms