Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3443F7CCV5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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