Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms