Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atf6F6VAN0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atf6F6VAN0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atf6F6VAN0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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